Estudios y Análisis Metagenómico

Llevamos a cabo el estudio y caracterización de la población microbiana (microbiota) presente en diferentes hábitats, corporales (intestinal, bucal, vaginal), medioambientales (terrenos de cultivo), productos alimentarios (conservas, envasados) o enología (tonelería), entre otros.

Para ello empleamos sistemas de secuenciación de última generación (secuenciación gen 16S microbiano, Shallow shotgun sequencing, Shotgun sequencing (próximamente)) y análisis bioinformático

Ofrecemos actualmente diferentes aproximaciones. Por un lado, secuenciación gen 16S microbiano, tanto del gen completo como de las regiones hipervariables V3 y V4.

A partir de unas coberturas medias de aproximadamente 100.000 lecturas por muestra, este tipo de ensayos permiten caracterizar la microbiota presente en una muestra, realizando la clasificación taxonómica y filogenética de las especies identificadas. Otra posibilidad es la realización del análisis mediante Shotgun que permite una mayor resolución taxonómica (especie), en comparación con el análisis del gen 16S, así como una mejor estimación de la diversidad microbiana presente en la muestra analizada.

Este servicio incluye, además, la posibilidad de realizar análisis bioinformáticos específicos a partir de archivos FASTQ obtenidos, identificación y cuantificación de secuencias génicas únicas, asignación taxonómica y realización de árboles filogenéticos.